오존층이 파괴되면서 지구는 치명적인 태양 광선에 무방비로 노출된다. 수많은 생명이 쓰러져 가자 코너 맥클라우드는 지구 전체를 감싸는 전자기 방어막 '실드'를 만들어 인류를 구해낸다. 그로부터 25년이 흐른 2024년, 세상은 영원한 밤과 숨 막히는 열기 속에 갇혀 있고, 실드를 장악한 거대 기업은 인류를 볼모로 막대한 이익을 챙기고 있다. 불멸의 힘을 잃고 노인이 되어 조용히 죽음을 기다리던 코너 앞에 실드 반대 운동을 이끄는 루이즈가 찾아온다. 그녀는 오존층이 이미 스스로 회복되었으며, 기업이 그 진실을 감추고 있다고 털어놓는다. 바로 그때 머나먼 과거에서 코너를 쫓아온 숙적 카타나 장군이 그의 목을 노리고 자객들을 보내고, 생사를 건 결투 끝에 코너는 잃어버렸던 젊음과 불멸의 힘을 되찾는다. 이제 죽음에서 돌아온 옛 스승 라미레즈와 다시 손잡은 코너는 인류에게 하늘을 돌려주기 위해 마지막 싸움에 뛰어드는데...