우주정복을 노리는 더 붐군은 라도리오 별을 침공. 라도리오 별의 로미나 공주는 이가 닌자의 전설을 찾아 라도리오 별을 구하기 위해 전함 엘샹크로 지구로 온다. 서력 2200년대의 지구에서는 인류는 달과 화성에 이주를 시작한 상황. 화성에 사는 소년 죠 마야는 더 붐군과 엘샹크의 전투를 목격하고, 엘샹크에 잠입한다. 그리고 엘샹크에 있는 로봇 흑자사로 더 붐군과 싸우게 되지만 고전. 그때 닌자의 모습을 하고 나타난 수수께끼의 로봇 토비카게가 흑사자와 합체해 압도적인 힘으로 더 붐군을 물리치는데...
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